SCUOLA DI BIOINFORMATICA 2007


La Scuola di Bioinformatica si rivolge a tecnici, laureati e dottorandi in discipline scientifiche (dei corsi di laurea di Scienze MFN, Medicina, Biotecnologie e Farmacia). Sono ammessi al corso anche coloro che vogliano affrontare le problematiche di utilizzo della bioinformatica provenendo dal mondo dell'industria o della ricerca universitaria.
La Scuola di Bioinformatica si articola in due moduli per ciascun livello – di base e avanzato – che possono essere frequentati anche singolarmente. Ogni modulo teorico è affiancato da esercitazioni pratiche.

L’orario delle lezioni previsto per tutti i moduli è 10.00-17.00.

LIVELLO BASE


Lingue del corso italiano/inglese,
materiale del corso in lingua inglese
Moduli accreditati al Ministero della Sanità (ECM)

MODULO 2 - Introduzione alla bioinformatica
Prof. Ferdinando Di Cunto, prof. Mauro Fasano

Le banche dati biologiche pubbliche costituiscono un sorgente ricchissima di informazioni, fondamentali per tutti gli ambiti della ricerca, sia di base che applicata. Tuttavia, allo stesso tempo, la loro molteplicità e ricchezza può porre notevoli problemi di orientamento a coloro che debbano consultarle. Questo corso è diretto a tutti i professionisti che debbano accedere ai principali database biologici, e si propone di fornire semplici ed efficaci linee guida per la loro consultazione e introduce all’uso dei principali strumenti bioinformatici.
L’accesso alle lezioni è a numero chiuso (massimo 20 partecipanti), le lezioni si svolgono interamente in aula informatica. Il programma di questo seminario di base prevede spazi per esercitazioni pratiche in aula.

Sede e date del corso


Molecular Biotechnology Centre
via Nizza 52, 10125 Torino

- 8-9 marzo 2007
- 21-22 giugno 2007
- 20-21 settembre 2007 

Argomenti


- Il sistema di intregrato ‘Entrez’

- Uso avanzato di PubMed

- Ricerca di sequenze nucleotidiche e aminoacidiche di interesse

- Intervallo

- Il problema degli alias: LocusLink e Entrez Gene

- Importanza delle sequenze EST: Unigene e TIGR gene index

- Ricerca di sequenze per omologia: il programma BLAST e le sue varianti

- Identificazione di geni ortologhi e paraloghi

- Intervallo
- Strumenti per l’analisi delle sequenze genomiche: il Golden Path

- dalla sequenza alla struttura

- conservazione dei domini strutturali. SMART e PFAM

- Classificazione strutturale delle proteine

- Identificazione di proteine da elementi di sequenza:
  proteomica e bioinformatica

- Esercitazioni libere su problematiche introdotte dai partecipanti.

- Determinazione strutturale della struttura proteica. Il Protein Data Bank

- Ricerca di coordinate attraverso interrogazione del PDB

- Visualizzazione delle coordinate mediante Swiss-PDB-viewer

- Esercitazioni libere su problematiche introdotte dai partecipanti.

Crediti ECM


Questo evento è accreditato presso il Ministero della Salute (n. 146-171302) ed ha ricevuto n.10 crediti ECM per tutte le figure professionali

Modalità di partecipazione


Il numero massimo di partecipanti per ogni modulo è di 20.
Le lezioni si terranno dalle ore 10 alle ore 17 presso il Molecular Biotechnology Center, Via Nizza 52, Torino.
Riceverà via e-mail le indicazioni per raggiungere la sede del seminario e le informazioni relative alle sistemazioni alberghiere.

Costi

€ 110.00+IVA 20% - totale € 132.00

La quota deve essere versata attraverso bonifico bancario sul conto corrente i cui estremi sono i seguenti:

Fondazione per le Biotecnologie
Istituto Bancario San Paolo di Torino, Ag. 1
C/c n. 104365
ABI 1025 - CAB 1001
Causale del versamento: cognome del partecipante e nome del modulo.
07.09.2007 a contattare la segreteria organizzativa ai recapiti in calce.

Segreteria organizzativa

Elisabetta Lombardini
Fondazione per le Biotecnologie
Villa Gualino - Viale Settimio Severo 63
10133 TORINO
tel. 011 6600187 - fax. 011 6600708
e-mail: elisabetta.lombardini@fobiotech.org

Coordinatori Scientifici

Prof. Ferdinando Di Cunto, prof. Mauro Fasano

 <07.09.2007;

updated 06.02.2007

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