SCUOLA DI BIOINFORMATICA 2006
La Scuola di Bioinformatica si rivolge a tecnici, laureati e dottorandi in discipline scientifiche (dei corsi di laurea di Scienze MFN, Medicina, Biotecnologie e Farmacia). Sono ammessi al corso anche coloro che vogliano affrontare le problematiche di utilizzo della bioinformatica provenendo dal mondo dell'industria o della ricerca universitaria.
La Scuola di Bioinformatica si articola in due moduli per ciascun livello – di base e avanzato – che possono essere frequentati anche singolarmente. Ogni modulo teorico è affiancato da esercitazioni pratiche.

L’orario delle lezioni previsto per tutti i moduli è 10.00-17.00.

LIVELLO AVANZATO
Lingue del corso italiano/inglese,
materiale del corso in lingua inglese

MODULO 3 – Bioinformatica avanzato
Prof. Ferdinando Di Cunto, prof. Mauro Fasano

Il sequenziamento del genoma umano, con tutti i relativi sviluppi tecnologici, ha determinato una svolta epocale nella ricerca biologica. Infatt, nel giro di pochissimi anni si è passati da una condizione in cui era fondamentale l’acquisizione di conoscenze sulla struttura e la funzione dei singoli geni e dei loro prodotti ad una situazione in cui questo tipo di informazione non è più considerato limitante.
Le principali banche dati pubbliche contengono oggi una enorme quantità di informazioni sulla struttura e la funzione dei geni di moltissimi organismi. I principali programmi bioinformatici rappresentano uno strumento fondamentale per poter utilizzare efficientemente queste informazioni a fini di ricerca. Questo corso è dedicato soprattutto a coloro che, per scopi di ricerca, debbano utilizzare strumenti di tipo bioinformatico. Il corso si propone di fornire i principi teorici fondamentali per capire il funzionamento dei principali algoritmi, e per poterne sfruttare tutte le potenzialità. Inoltre verrà dato ampio spazio ad esercitazioni pratiche su casi reali. I partecipanti sono incoraggiati a proporre sequenze di loro interesse.

Villa Gualino, Torino, 9-10 ottobre 2006 *** lista d'attesa ***

ARGOMENTI
- Valutazione della similitudine tra due sequenze mediante Dot Plot
- Allineamento globale e locale di coppie di sequenze
- Principi di funzionamento del programma BLAST
- Modifica dei principali parametri di BLAST per un utilizzo avanzato
- matrici di similitudine posizione-specifica (PSSM)
- PSI-BLAST come strumento per la ricerca di omologia
- Esercitazioni: definizione di PSSM per una famiglia di proteine
- Allineamento multiplo: CLUSTALW
- Modellizzazione di allineamenti multipli: famiglie di domini conservati
- Predizione di strutture geniche in sequenze genomiche: GeneScan
- Integrazione tra metodi di allineamento e metodi predittivi nella definizione delle strutture geniche
- Correlazione sequenza struttura
- Determinazione sperimentale della struttura proteica. Diffrazione raggi x, NMR
- Analisi ed interrogazione del Protein Data Bank
- Metodi predittivi
- Metodi comparativi (per omologia)
- Threading/Fold recognition
- Metodi ab initio
- Validazione del modello

MODALITA’ DI PARTECIPAZIONE
Il numero massimo di partecipanti per ogni modulo è di 20.
Le lezioni si terranno dalle ore 10 alle ore 17 presso l’aula di Informatica Fondazione per le Biotecnologie, a Villa Gualino, Viale Settimio Severo 63, Torino. Riceverà via e-mail le indicazioni per raggiungere la sede del seminario.
Presso il centro congressi è disponibile un self-service per i pasti (€ 13,00) e un bar. Sono disponibili stanze singole (€ 56,00) e stanze doppie (€ 88,00) presso L’hotel Villa Gualino***, sede del corso.

COSTI
€ 110.00+ IVA 20% - totale € 132.00

Il costo di iscrizione di ciascun modulo comprende il materiale didattico, le colazioni di lavoro e l’attestato di partecipazione.
La quota deve essere versata attraverso bonifico bancario sul conto corrente i cui estremi sono i seguenti:

Fondazione per le Biotecnologie
Istituto Bancario San Paolo di Torino, Ag. 1
C/c n. 104365
ABI 1025 - CAB 1001
Causale del versamento: cognome del partecipante e nome del modulo.

Per prenotazioni alberghiere e informazioni, siete invitati a contattare la segreteria organizzativa ai recapiti in calce.

SEGRETERIA ORGANIZZATIVA
Fondazione per le Biotecnologie
Villa Gualino - Viale Settimio Severo 63
10133 TORINO
tel. 011 6600187 - fax. 011 6600708
e-mail: mail@fobiotech.org

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