Introduzione alla Bioinformatica
Scuola di bioinformatica
MODULO 2 – INTRODUZIONE ALLA BIOINFORMATICA
23/24 settembre 2010
Responsabile Scientifico: Ferdinando Di Cunto, Dip. Genetica, Biologia e Biochimica, Università di Torino
Sede: Molecular Biotechnology Center, Università di Torino
LIVELLO BASE
Lingue del corso italiano/inglese,
materiale del corso in lingua inglese
MODULO 2
Introduzione alla bioinformatica
(corso ECM)
Docenti: Prof. Ferdinando Di Cunto, Prof. Mauro Fasano,
Dr. Christian Damasco, Dr. Ugo Ala
SEDE
Molecular Biotecnology Center, Università di Torino
via Nizza 52, Torino
DURATA
2 giorni
QUOTA DI ISCRIZIONE
€ 120.00 + IVA 20% (totale € 144,00)
Prerequisiti
conoscenze di fisica e chimica e biologia a livello universitario
Le banche dati biologiche pubbliche costituiscono una sorgente ricchissima di informazioni, fondamentali per tutti gli ambiti della ricerca, sia di base che applicata. Tuttavia, allo stesso tempo, la loro molteplicità e ricchezza può porre notevoli problemi di orientamento a coloro che debbano consultarle. Questo corso è diretto a tutti i professionisti che debbano accedere ai principali database biologici e si propone di fornire semplici ed efficaci linee guida per la loro consultazione e introduce all’uso dei principali strumenti bioinformatici.
Argomenti
- Il sistema di intregrato‘Entrez’
- Uso avanzato di PubMed
- Ricerca di sequenze nucleotidiche e aminoacidiche di interesse
- Intervallo
- Il problema degli alias: LocusLink e Entrez Gene
- Importanza delle sequenze EST: Unigene e TIGR gene index
- Ricerca di sequenze per omologia: il programma BLAST e le sue varianti
- Identificazione di geni ortologhi e paraloghi
- Intervallo
- Strumenti per l’analisi delle sequenze genomiche: il Golden Path
- dalla sequenza alla struttura
- conservazione dei domini strutturali. SMART e PFAM
- Classificazione strutturale delle proteine
- Identificazione di proteine da elementi di sequenza: proteomica e bioinformatica
- Esercitazioni libere su problematiche introdotte dai partecipanti.
- Determinazione strutturale della struttura proteica. Il Protein Data Bank
- Ricerca di coordinate attraverso interrogazione del PDB
- Visualizzazione delle coordinate mediante Swiss-PDB-viewer
- Esercitazioni libere su problematiche introdotte dai partecipanti.
Crediti ECM
Sono stati proposti i seguenti crediti ECM:14 per tecnico sanitario di laboratorio biomedico; 12 per le figure di medici, farmacisti, biologi e chimici
Modalità di partecipazione
I moduli DI TUTTI I LIVELLI non hanno propedeuticità, possono essere frequentati in numero variabile a seconda degli interessi e delle necessità di aggiornamento di ciascuno. Non è prevista selezione, ma per facilitare l’autovalutazione del livello di ingresso da parte dei partecipanti ad ogni modulo sono associati i requisiti minimi consigliati per una partecipazione efficace. I moduli in presenza sono a numero chiuso, i posti disponibili 30 e vengono assegnati in ordine di iscrizione. Quanti fossero in lista di attesa avranno precedenza sulla partecipazione all’edizione successiva del modulo prescelto, ma ovviamente nessun obbligo. I moduli non vengono attivati per un numero di iscritti inferiore ai 10.Ogni modulo teorico è affiancato da esercitazioni pratiche. L’orario delle lezioni previsto per tutti i moduli in presenza è 10.00-17.00, ma la durata di ciascun modulo varia. Costi di iscrizione e durata sono indicati alla fine del programma di ciascun modulo.
NB. Le date possono subire lievi modifiche in base alla disponibilità dei docenti
Per iscriversi, compilare la registration form
Il costo di iscrizione comprende la partecipazione alle lezioni, il materiale didattico, l’attestato di partecipazione e l’attestato ECM a quanti ne abbiano diritto.
Modalità di pagamento
La quota deve essere versata, dopo aver ricevuto messaggio di conferma da parte della segreteria organizzativa, tramite bonifico bancario o carta di credito online
1 Bonifico bancario
Fondazione per le Biotecnologie
BANCA PROSSIMA
Filiale 500 Milano
c/c 10943
IBAN IT93S0335901600100000010943
BIC BCITITMX
Causale del versamento: cognome del partecipante e nome del modulo
2 Carta di credito
Vitto, alloggio e trasporti
La segreteria organizzativa provvederà ad inviare un elenco degli hotel consigliati nella zona della sede dei corsi, che è centrale, ben servita con i mezzi pubblici e comoda dalla stazione ferroviaria Porta Nuova di Torino.
Per informazioni siete invitati a contattare la
segreteria organizzativa:
Elisabetta Lombardini
Fondazione per le Biotecnologie
Villa Gualino, Viale Settimio Severo 63
10133 – TORINO
tel. 011 6600187
fax. 011 6600708
elisabetta.lombardini@fobiotech.org
www.elearning.fobiotech.org
